法律分析：一个单位有两枚公章同时在使用是违法。
法律依据：《印章治安管理办法》 第十二条 印章不得单刊外文，需要中、外文并刊的，应提出书面申请并持有关证明、文件到地、市级以上机关办理准刻手续。《印章治安管理办法》还规定印章使用单位只能刻制一枚法定名称章。